英伟达推出BioIR运行时 8卡H100蛋白折叠效率提升2.9倍

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21 天前

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英伟达日前推出针对生物计算场景优化的BioNeMo推理运行时（BioIR），在8张H100 GPU组成的集群上测试显示，该框架可实现Boltz-2蛋白折叠任务2.90倍的吞吐量提升，单GPU每小时可完成58.5K个氨基酸残基的折叠计算，大幅降低生命科学领域AI药物研发、分子模拟等场景的算力成本。

近年来AI技术在蛋白结构预测、分子对接、新药研发领域的落地速度持续加快，以AlphaFold、Boltz系列为代表的蛋白折叠模型已经成为药企、科研机构的核心工具，但这类模型普遍对算力要求极高，单条长序列蛋白的折叠计算往往需要数小时甚至数天的GPU运算时间，高昂的算力成本成为中小团队落地相关技术的核心障碍。

英伟达本次推出的BioIR是旗下BioNeMo生物计算大模型平台的专属推理加速组件，针对Boltz-2等主流蛋白折叠模型的计算逻辑做了底层算子优化，不需要改动模型代码即可实现效率提升。官方测试数据显示，在8xH100 GPU的标准测试环境下，搭载BioIR的Boltz-2模型折叠吞吐量达到原生版本的2.90倍，单GPU每小时可处理58.5K个氨基酸残基，相当于完成一条长度为1000残基的蛋白序列折叠仅需约1分钟，较此前的计算速度提升超2倍。

BioIR的推出也意味着英伟达正在进一步强化自身在AI生物计算赛道的生态话语权，目前BioIR已经向BioNeMo平台的企业用户开放测试，后续还将适配更多主流分子模拟、蛋白设计模型。业内分析认为，随着底层算力效率的持续提升，未来AI药物研发、合成生物学等领域的技术落地成本将进一步降低，中小科研团队、初创药企也能用上此前只有头部机构才能负担的大算力计算资源。

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